羅伊氏乳桿菌（Lactobacillus reuteri）屬于革蘭氏陽性菌，發(fā)酵特性為異性乳酸發(fā)酵，常存在于人或其它動物腸道中。已有大量研究證明，L. reuteri具有一定的益生功效，例如調(diào)節(jié)宿主免疫系統(tǒng)、產(chǎn)生廣譜抗菌化合物、預(yù)防腹瀉和結(jié)腸炎等。近年來，L.reuteri已被作為脊椎動物腸道共生體的模型來研究生態(tài)和進(jìn)化。然而，關(guān)于食草動物腸道中L.reuteri遺傳進(jìn)化研究卻鮮有報道。

    基于以上現(xiàn)狀，內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點實驗室研究人員將分離自山羊、綿羊、馬、牛腸道中的16株L.reuteri進(jìn)行基因組重測序，結(jié)合已公布的17株雜食動物腸道分離株和4株酸面團(tuán)分離株進(jìn)行比較基因組學(xué)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)來源于不同宿主的L.reuteri進(jìn)化歷程各異，且某些與細(xì)菌黏附特性有關(guān)的細(xì)胞表面蛋白編碼基因和碳水化合物活性酶編碼基因具有宿主特異性。該研究進(jìn)一步證實，不同生境來源的L.reuteri遺傳多樣性與其生存環(huán)境息息相關(guān)。

    該研究“Comparative genomics of the herbivore gut symbiont Lactobacillus  reuteri reveals genetic diversity and lifestyle adaptation”已于2018年3月發(fā)表在《Frontiers in Microbiology》（JCR2區(qū)，IF:4.019）。

原文鏈接：
https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01151

FIGURE 1 .Phylogeny of Lactobacillus reuteri was inferred using a maximum likelihood method.


FIGURE 2 .Shared and unique gene families of Lactobacillus reuteri strains from different clades of herbivore-derived L. reuteri strains (A). Venn plot showing shared
and unique genes distribution (B). A heatmap representation of BLASTN comparison of specific genes against sequenced  L. reuteri genomes.